Una nuova operazione per la verifica degli alberi

Quando Sierra Gold Nurseries consegna un lotto di nuovi alberi, l'azienda vuole essere sicura che la varietà e il portainnesto corrispondano all'etichetta. Così fa ogni asilo nido.

I recenti investimenti nella tecnologia di screening del DNA e gli aggiornamenti alle procedure di verifica genetica dell'Università della California rendono più facile per gli asili nido come Sierra Gold mantenere questa promessa.

"È l'unico modo in cui possiamo operare", ha affermato Reid Robinson, direttore operativo di Sierra Gold. "Le confusioni sono terribili per i nostri clienti e sono terribili per noi."

Come molti vivai, Sierra Gold di Yuba City, California, ha iniziato a utilizzare la reazione a catena della polimerasi, o PCR, macchine per lo screening genetico per verificare le piante ricevute dai coltivatori e per ricontrollare la tenuta dei registri nel proprio laboratorio di coltura dei tessuti e nei frutteti di germogli.

L’azienda ha acquistato la sua macchina PCR convenzionale, che utilizza l’elettroforesi su gel, nel 2017 dopo aver ricevuto da un laboratorio fidato una selezione di ciliegie non commerciale etichettata erroneamente come Chelan, e l’ha inconsapevolmente venduta. Nel 2020, l'azienda ha acquistato una macchina per PCR in tempo reale. Una volta appannaggio esclusivo dei laboratori di ricerca benestanti, la tecnologia in tempo reale esegue 96 test in modo più accurato nello stesso lasso di tempo in cui la versione precedente ne eseguiva 16.

"Si ottengono molti più dati e si ottengono dati molto più affidabili", ha affermato Micah Stevens, responsabile del laboratorio di ricerca presso Sierra Gold.

Nel frattempo, il sistema fuori dalle mura degli asili nido è cambiato.

Quest'anno, la Foundation Plant Services dell'Università della California, Davis, ha iniziato a richiedere ai clienti, come allevatori, vivai, altre università e, talvolta, coltivatori, che portano materiale al laboratorio, di inviare anche un campione di tessuto precedentemente verificato: un "voucher" ” – per i confronti del DNA, ha detto Maher Al Rwahnih, direttore della fondazione. I tecnici poi propagheranno la pianta, la coltiveranno e la confronteranno con il buono. Se corrisponde, continueranno a far crescere gli alberi per almeno due anni, per i test antivirus, e poi effettueranno nuovamente lo screening del DNA.

In precedenza, la fondazione veniva testata solo alla fine del processo, a volte dopo che i clienti con cui lavoravano avevano già rilasciato versioni provvisorie.

Nel 2019, la fondazione si è accorta di un errore, attraverso il campionamento del DNA back-end, rivelando che alcuni portinnesti di ciliegio Gisela 5 erano in realtà Gisela 6, un'opzione meno nanizzante, dopo che il materiale era stato provvisoriamente rilasciato al cliente. A quel punto aveva raggiunto le piantagioni commerciali. Se la fondazione avesse utilizzato il nuovo protocollo, l’errore sarebbe stato scoperto prima, ha detto Al Rwahnih.

Errori come questi sono rari, ha detto Al Rwahnih, ma possono accadere.

La questione è diventata più urgente con il lancio di nuove varietà e un aumento della domanda per testare mele, pere e drupacee.

"Dobbiamo lavorare tutti insieme per evitare errori", ha detto Al Rwahnih.

I clienti si rivolgono alla fondazione principalmente per i test antivirus, ma ricevono la verifica fedele al tipo come parte del pacchetto. Entrambi fanno parte del suo mandato nell'ambito del programma di registrazione e certificazione di alberi di noci e frutti decidui del Dipartimento dell'Agricoltura della California. Il laboratorio addebita 355 dollari a campione per il servizio per alberi da frutto e vite.

Questo è diverso dal Clean Plant Center Northwest, situato presso le strutture della Washington State University a Prosser, che ha solo il mandato di effettuare lo screening delle malattie. In effetti, il contratto del laboratorio Prosser con il National Clean Plant Network del Dipartimento dell'Agricoltura degli Stati Uniti vieta espressamente altri test: “Il Network riconosce l'importanza di mantenere e verificare l'identità delle piante clonate, inclusa la fedeltà al tipo; tuttavia, il rilevamento delle impronte digitali del DNA e il lavoro sulla fedeltà alla tipologia potrebbero non essere supportati attraverso questo finanziamento”.

In passato, il centro Prosser ha ricevuto fondi statali per la genotipizzazione della vite e ha utilizzato l'FPS della California per svolgere tale ruolo, ha affermato Scott Harper, direttore del centro. Il laboratorio ha anche aiutato le aziende che richiedono servizi di genotipizzazione a trovare un laboratorio privato.